Hablaba casi siete horas después del siniestro el ministro de Transportes desde el centro de control de Atocha. Oscar Puente hablaba de una decisión inexplicable del técnico al mando contraria al protocolo como causa del accidente.  Hasta en 6 ocasiones ha esgrimido hoy Oscar Puente este argumento. Según ha explicado  Puente, Todo comenzaba alrededor de las 8:30 con la caida del sistema LZB de seguridad. Los 6 trenes que circulaban por la zona se detienen como manda el protocolo. Toma entonces el control el centro de mando de Atocha y es aquí donde, dice el ministro, se toma la decisión de activar la marcha del AVE mientras el tren Iryo seguía detenido en su via. El AVE ha recorrido 25 Kilómetros hasta que se ha encontrado en la via con el Iryo, momento en el que se ha producido la colisión.

Queda una pregunta pendiente...Si esto fue así, ¿por qué el tren Iryo no retomó la marcha? Puente no parecía tener la respuesta. Lo que si ha procurado en todo momento el ministro es mantener la prudencia y no hacer valoraciones, aunque si ha definido lo ocurrido como algo inverosímil en nuestro sistema ferroviario.

La Guardia Civil ha interrogado ya al operario del centro de control de Adif responsable de la regulación del tráfico ferroviario en la línea de alta velocidad Madrid-Sevilla en el momento del accidente.